2004, Número 1
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Rev Mex Ing Biomed 2004; 25 (1)
Simulación de los mínimos de interacción de cafeína con las bases de los ácidos nucleicos y sus rutas de transición
Deriabina A, Cruz A, González E, Grokhlina TI, Poltev VI
Idioma: Español
Referencias bibliográficas: 24
Paginas: 34-43
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RESUMEN
La cafeína influye en un amplio conjunto de
procesos biológicos. Para explicar los mecanismos moleculares de esta
influencia realizamos cálculos de la energía de interacción de
cafeína con fragmentos de los ácidos nucleicos por los métodos de la
mecánica molecular. Los cálculos revelan tres tipos de arreglos de
mínimos de energía de interacción entre cafeína y las bases (pares de
bases) del ADN. Además de las conocidas posiciones mutuas de
apilamiento (stacking), se encontraron otros dos tipos de arreglos;
planos y perpendiculares. Estos dos arreglos son posibles para
monómeros de ácidos nucleicos individuales y dúplex de ADN. Además se
encontraron las rutas de transición entre los mínimos locales de
interacción CAF-base. Los cálculos sugieren una posible influencia de
la cafeína en la interacción del ADN con otras moléculas biológicamente
activas, a través de la formación de complejos con pares de bases y
ligandos.
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