López-Valle ML, Shishkova S

Idioma: Español
Referencias bibliográficas: 0
Paginas: 13-26
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RESUMEN

Los microRNAs (miRNAs) son RNAs pequeños no codificantes de 20-24 nucleótidos que regulan la expresión génica mediante silenciamientos la identificación de novo de miRNAs se basa en las particularidades de su biogénesis. A grandes rasgos, los criterios considerados son: la identificación de un transcrito que se pliega en una estructura secundaria de tallo-asa, así como las secuencias del miRNA y del miRNA* encontradas en los resultados de secuenciación de RNAs pequeños. Estas secuencias deben ser casi perfectamente complementarias, mapearse sobre el tallo de dicha estructura secundaria con un desfase de 2 nucleótidos y representar la mayoría de las lecturas que se mapean sobre la estructura de tallo-asa. Este artículo presenta información sobre la base de datos de miRNAs, miRBase, miRNAs conservados y linaje-específicos, haciendo hincapié en los miRNAs de plantas. Se describen los procedimientos de identificación de novo de miRNAs por predicción de la estructura de tallo-asa. Para esto se utilizan datos de secuenciación masiva de RNAs pequeños y de genoma o transcriptoma. Se describen tambien los métodos de predicción y validación de transcritos-blancos de miRNA.